Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms