Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Vmn1r34G3XA52 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Vmn1r34G3XA52 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Vmn1r34G3XA52 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Vmn1r34G3XA52 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Vmn1r34G3XA52 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Vmn1r34G3XA52 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Vmn1r34G3XA52 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r34G3XA52 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r34G3XA52 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r34G3XA52 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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