Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms