Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms