Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10378F6XQQ1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10378F6XQQ1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10378F6XQQ1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm10378F6XQQ1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm10378F6XQQ1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10378F6XQQ1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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