Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pagr1bF6V0H0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pagr1bF6V0H0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pagr1bF6V0H0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pagr1bF6V0H0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pagr1bF6V0H0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pagr1bF6V0H0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pagr1bF6V0H0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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