Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmod3E9QA62 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms