Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85cE9Q6B2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms