Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gm20518E9Q548 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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