Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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ApobE9Q414 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms