Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms