Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms