Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9972E9Q053 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms