Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms