Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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