Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms