Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AU015836B2RUM3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms