Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Grik3B1AS29 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Grik3B1AS29 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Grik3B1AS29 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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