Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr29B1ARI9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr29B1ARI9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr29B1ARI9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr29B1ARI9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr29B1ARI9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms