Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms