Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms