Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms