Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms