Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms