Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms