Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5538W4VSP6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms