Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Krt27Q9Z320 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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