Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hdac6Q9Z2V5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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