Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip6Q9Z1Y4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms