Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms