Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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