Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms