Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sh3bgrQ9WUZ7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Sh3bgrQ9WUZ7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms