Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Nek3Q9R0A5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nek3Q9R0A5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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