Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms