Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Phtf1Q9QZ09 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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