Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms