Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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