Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms