Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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