Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtsmQ9JL96 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms