Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancaQ9JL70 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms