Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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