Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms