Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms