Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms