Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ube3bQ9ES34 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms