Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cse1lQ9ERK4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms