Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms