Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall1Q9ER74 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall1Q9ER74 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms